产品应用丨StoragePod®让化合物储存变得简单

发布日期:2024-04-01


概要

生物医药领域普遍使用DMSO进行化合物储存,但是该方法在溶液测试的完整性方面存在很高的风险。目前,人们对这些溶解后的储存液发生变化所造成的后果知之甚少,也缺乏相应的管理措施。本报告提供的数据将阐明这一领域的关键问题,并为避免相关风险提供明确的指导方向。

背景

由于DMSO具有优异的溶解能力、化学惰性和高沸点和凝固点,因此在生物实验中测试的化合物通常溶解在DMSO中。然而,最近发表在文献中的研究结果表明,DMSO具有高度亲水性的特点,如果将其置于室温条件下,则会迅速吸水。这可能会对溶解后的化合物储存产生不利影响,因为它可能:

  • 降低储存液浓度(通过吸水稀释)

  • 诱导化合物沉淀

  • 促使化合物在储存液中结晶

  • 增加化合物降解


目前,各部门化合物的储存条件差异很大,这就会带来实验条件上的不一致性。这就使溶解后的储存液会经历上述一种或所有情况的风险;这可能导致储存液浓度出现误差,进而影响到使用该化合物的所有检测过程。因此,生物检测中使用的化合物的实际浓度将低于实验设计的浓度,导致统计分析中使用的数据是不准确的。


我们进行了一项实验,直接量化DMSO吸水后的化合物稀释。在阿斯利康常用的储存条件下,对溶解样品的吸水率进行了监测;这种吸水率被用来计算化合物储存液的稀释度。然后利用这些数据来评估在此类数据的统计分析中使用不准确浓度的影响,并展示关键业务的决策可能受到的影响。

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方法

本实验使用了九种化合物,包含三个不同的化学系列和三个分子量段(300、400和500)。利用TecanEVO 全自动液体处理工作站,将这些化合物溶解在2mL的Fishervials*瓶中,瓶上带有透气性的隔膜,并记录初始体积(所有体积均通过称重,并使用水和DMSO的校准曲线计算得出)。化合物的重复组置于不同的储存条件下:室温、冰箱(4℃)和StoragePod(氮气环境)。在四周的时间内,定期对样品进行称重,并记录所有测量值。图 1展示了体积增加量和储存液浓度随时间变化的图。起始体积为 500ul,因此增加了100ul水相当于样品浓度从10mM降至8.3mM。

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结果

图1:在室温、冰箱和氮气环境下,10mM样品储存在2mL带有透气性的隔膜的Fisher小瓶中,体积增加量和储存液浓度随时间变化图。每条曲线对应一瓶的化合物。


图1中的结果表明,在室温和4℃温度下,DMSO的吸水量随着时间的推移迅速增加。在氮气环境中储存四周的化合物吸水量极小(如两幅图所示)。不同化合物溶解后的结果之间存在相当大的差异,尤其是在4℃时,因为大气会产生冷凝现象。统计分析表明,这种差异似乎与化合物的化学系列或分子量无关,意味着无法弥补误差。当化合物储存在氮气环境下的StoragePods中,并不会有任何问题。


需要重申的是,水不是造成化合物储存液的稀释的唯一来源。由于化合物沉淀、结晶和降解的风险,下文统计分析中会看到对储存液更大的影响。在为期四周的测试过程中,九种化合物中有四种在室温和4℃下析出;而在氮气环境下储存的化合物则不存在这个问题。

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对LogIC50计算的影响:

用计算机模拟评估低起始浓度化合物的下游影响。图 2中左图显示了在典型的生物测定中,当储存液浓度降低达3mM时,对LogIC50的估计值的平均百分比变化。显然这种效力被大大低估了。例如,当储存液浓度从10mM降至8mM时,LogIC50= -1.58 的化合物(IC50= 0.0263uM,PIC50= 7.58)的LogIC50通常会降至-1.48左右(IC50= 0.0331uM,PIC50= 7.48)。由于 DMSO的亲水性一般会对化合物产生不同的影响,这可能会影响化合物的排名顺序并导致误导性结果。



图2:不同储存液浓度降低时,LogIC50估计值的平均增长百分比及其真实标准偏差。


图2的右图显示了LogIC50估计值的平均标准偏差。随着储存液浓度的降低,这些平均标准偏差也会迅速增大。这与标准统计分析得出的结果不同,标准统计分析得出的平均标准偏差总是与实验中正确设置浓度时的平均标准偏差相近。例如,当储存液浓度从10mM降至8mM时,LogIC50的估计标准偏差为0.0971,而不是常规统计分析中的0.0117(大八倍多)。对变异性的低估可能会导致对数据质量的错误认知,并导致不正确的功效分析(例如,需要进行多少次观察和重复)。

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结论

事实证明,任何统计分析都无法正确分析数据,因为测试的真实浓度一般都是未知的。由于浓度的降低没有明显的规律可循,因此无法使用校正因子。因此,必须确保尽可能减少DMSO吸水的不利影响。


为此,我们购买了可在氮气和低相对湿度条件下储存化合物的设备。这些条件符合最佳实验条件,可确保溶解后的化合物库储存液得到合适的储存。在这些条件下储存溶解后的化合物将有助于最大限度地降低本报告中强调的风险,从而提高数据质量,进而做出更明智的商业决策。


*Finneran vials (4100-1232) shell borosilicate glass clear 2.0mL 12 x32mm.

Finneranconical snap plugs (5405SB-12) with starburst natural plugpolypropylene clear 12mm.


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