测序成本的降低使散弹枪宏基因组和扩增子测序得以广泛使用,这极大地提高了人类对微生物世界的理解。然而,大型测序项目现在依然受到文库制备成本高和样本通量低的阻碍。本文对三种高通量DNA提取方法进行了测试:ZymoBIOMICS™ DNA试剂盒MP Biomedicals™ DNA试剂盒DNeasy®试剂盒根据长度、质量、数量和微生物群落对DNA提取结果进行了评价。所有土壤类型的DNA提取都很成功,进一步使用纳升级移液系统I. DOT one将Illumina扩增子和宏基因组文库制备体积分别缩小了5倍
癌症干细胞假说认为,肿瘤由一小群表现出干细胞特性的细胞驱动和维持。研究人员依赖于肿瘤球形成实验来识别和扩增这些癌症干细胞[1]。肿瘤球是来自癌症干细胞的固态球形细胞形成,不是由其他来源的细胞聚集而成。这些细胞可在无血清、非粘附条件下生长,并且可以在体外用于表征癌症干细胞群体[2]。MCF-7是一种模型乳腺癌研究细胞系,用于乳腺球测定,用CD44和CD24等标记物检测癌症干细胞特性。乳腺球发育的关键步骤是分离单细胞,然后计算成球效率(SFE)[3]。在传统的肿瘤球形成实验中,细胞的接种密度通常在每
微藻是一类十分多样的生物,作为初级生产者发挥着至关重要的生态作用,并对水生光合作用做出了重大贡献。微藻也越来越多地被使用于生产可再生燃料、食品、保健品和其他生物制品。荧光细胞分选可用于在基础研究中富集所需的微藻种群,例如发现和分离新物种,以及为各种生物技术应用开发稳定的工程菌株。
DNA的修复功能是维持细胞正常生理功能和稳定遗传性的重要因素,其中DNA双链断裂(DSB)的修复机制包括BRCA1/2介导的同源重组(HR)和典型的 DNA-PKcs介导的非同源末端连接(c-NHEJ)。对c-NHEJ DNA末端修复通路复合物的结构及功能的了解是应对损伤应答修复机制缺陷相关疾病的科学基础。在该通路中,蛋白Ku70和Ku80形成的异源二聚体(统称Ku)是最重要的蛋白复合物。通过电镜及X射线对蛋白复合物及晶体结构的分析,已经阐明代谢物IP6(六磷酸肌醇)能够与Ku相互作用,并在原子
SARS-CoV-2大流行的出现引发了大量有关冠状病毒进入宿主细胞机制的功能和结构研究。冠状病毒进入宿主细胞的机制是由跨膜刺突糖蛋白(transmembrane spike glycoprotein)介导的,这种糖蛋白与人类血管紧张素转换酶2(ACE2)紧密作用,形成从病毒表面突出的三聚体。这种蛋白随后会被宿主蛋白酶裂解,从而通过不可逆的构象变化激活蛋白进行膜融合。使用质量光度法可以检测样本中刺突糖蛋白的寡聚状态、其与ACE2的相互作用以及直接与ACE2结合的受体结合域(RBD)的构象状态等一些
在生物制药和生物技术产业中,工程化哺乳动物细胞和微生物被广泛用于大规模生物反应器系统中生产蛋白质产品。溶解氧(DO)是细胞或微生物生长、维持和生产过程中的基本基质。在生物过程的规模放大阶段,氧传递系数(KLa)是寻找生物反应器最佳培养条件的关键参考因素。KLa参数控制着氧气从气相转移到液相的速率,并可能受到生物反应器多种因素的影响,如混合速率、气流速率、气泡大小、不同的液体或培养基等[1]。